Vernazza ble grunnlagt rundt år tusen. Navnet kommer fra "Gens Vulnetia," en gammel romersk familie. Slavene som en gang frigjorde seg og grunnla byen, tilhørte denne familien. Vernazza var en gang den mest velstående byen Cinque Terre. Byens historiske sentrum har bevart de vakreste arkitektoniske elementer, for eksempel boliger, arkader og hovedporten. Byen streker seg til toppen av klippen langs bekken Vernazzola, som er nå dekket. I Vernazza finner en mange blinde smug knyttet med bratte trapper. Der ligger det vaktestasjoner, tårn og slott av slekt Doria, et symbol på byens tidligere økonomiske betydning. Ved porten ligger det sognekirken Santa Margherita d'Antiochia, med sitt åttekantede klokketårn.